지난 4월 20일 한서노회 재판국(국장 김달수)은 제자교회 장로 7명을 제명·면직·출교했다. 교회 장로가 정삼지 목사 외 6명(김일우·이준수·김동현 목사, 함재현·구자학·맹원재 장로)을 검찰에 고발했다는 것과 교회의 장부를 열람할 수 있게 해 달라고 법원에 신청했다는 이유 때문이다. (관련 기사 : 한서노회, 제자교회 장로 7명 출교)

출교된 제자교회 장로들은 노회의 출교 판결에 불복하여 총회에 상소했다. 또한 △당회에서 투표권이 없는 사역장로(노일래 장로)를 권징 당회에서 불법으로 투표하게 한 것 △시무장로 1명을 생일이 지나기 전에 사역장로로 공고한 것 △당회 성수가 안 됨에도 당회를 개회하고 심규창 장로 등 7명을 시무 해임한 것은 불법이라며 총회에 소원했다. 이 소원도 상소와 함께 재판국으로 이첩됐다.

한편 제자교회는 안수집사 3명(이봉진, 김광묵, 정홍균)을 제명·면직·출교하고, 집사 1명(김경옥)을 제명·출교했다고 5월 16일 자 주보에 공지했다. 이봉진 안수집사는 담임목사에게 "목사직에서 물러나라"는 내용의 공개 서신을 보낸 것(관련기사 : "담임목사님보다 하나님이 더 두렵습니다")과 지난해 정 목사를 고발하는 기자 회견(관련 기사 : 제자교회 문제 결국 검찰로)에 참여했다는 이유다. 김광묵, 정홍균 안수집사도 정 목사를 고발하는 기자 회견에 참여했다는 이유로, 김경옥 집사는 정 목사 측인 유기중 시무장로의 넥타이를 잡는 등 소란을 피웠다는 이유다.